Την πιστοποίηση ISO 14001:2004 έλαβε η Aegean Airlines από την TÜV AUSTRIA HELLAS για τo Σύστημα Περιβαλλοντικής Διαχείρισης για τον τομέα Εξυπηρέτηση Επιβατών – Εξυπηρέτηση Αεροσκαφών και Συντήρηση Αεροσκαφών που εφαρμόζει στον κεντρικό σταθμό της στο Διεθνή Αερολιμένα Αθηνών.
Η Aegean Airlines, όπως επισημαίνει σε ανακοίνωσή της, είναι ο μοναδικός αερομεταφορέας στην Ελλάδα που έχει πιστοποιηθεί κατά ISO 14001:2004.