Σε αγρότες με αιτήσεις για ποσά επιστροφής ΦΠΑ άνω των 10.000 ευρώ θα γίνουν κατά προτεραιότητα οι έλεγχοι τους οποίους προγραμματίζει να προχωρήσει άμεσα στο υπουργείο Οικονομικών, σύμφωνα με εγκύκλιο του υφυπουργού Οικονομικών Δ. Κουσελά. Θα ακολουθήσουν οι έλεγχοι για ποσά επιστροφών κάτω των 10.000 ευρώ.
Αν από τον προληπτικό έλεγχο αποδειχθεί ότι στην αίτηση για την επιστροφή περιλαμβάνονται εικονικά ή πλαστά φορολογικά στοιχεία ή υπάρχουν υπόνοιες ότι τα ποσά που αναγράφονται δεν ανταποκρίνονται σε πραγματικές συναλλαγές, θα εκδίδεται εντολή να διενεργηθεί φορολογικός έλεγχος.
Όπως αναφέρεται στη σχετική εγκύκλιο, ο έλεγχος θα πρέπει να ολοκληρώνεται το αργότερο εντός τεσσάρων μηνών από την υποβολή της αίτησης επιστροφής, ενώ η απόφαση για την επιστροφή θα εκδίδεται σε ένα μήνα από την ολοκλήρωση του ελέγχου.