Το Μετρό της Θεσσαλονίκης υποδεικνύει η Κομισιόν ως παράδειγμα έργου του ΠΕΠ Μακεδονίας – Θράκης που καθυστερεί ιδιαίτερα, όπως αναφέρει ο ευρωβουλευτής του ΣΥΡΙΖΑ Νίκος Χουντής, ο οποίος είχε καταθέσει ερώτηση στον αρμόδιο Επίτροπο για την Περιφερειακή Πολιτική, Γιοχάνες Χαν, σχετικά με την πορεία υλοποίησης του προγράμματος.
Στην ερώτησή του συγκεκριμένα ο ευρωβουλευτής, αφού αναφερόταν σε στοιχεία της Eurostat που έδειχναν τα υψηλά ποσοστά ανεργίας που εμφανίζονται στις περιφέρειες της Μακεδονίας και της Θράκης, και δεδομένου ότι «η αξιοποίηση και η καλύτερη χρήση των κοινοτικών κονδυλίων, και συγκεκριμένα των Περιφερειακών Επιχειρησιακών Προγραμμάτων (ΠΕΠ), θα μπορούσαν να βοηθήσουν στην ανάσχεση της οικονομικής κατάρρευσης των ελληνικών περιφερειών», ζητούσε, μεταξύ άλλων, από την Κομισιόν, να του παραθέσει στοιχεία για την μέχρι τώρα πορεία υλοποίησης του σχετικού ΠΕΠ καθώς και τους άξονες και μέτρα που παρουσιάζουν τις μεγαλύτερες καθυστερήσεις.
Σύμφωνα με τον κ. Χουντή, στην απάντησή του ο κ. Χαν αφού χαρακτηρίζει «ικανοποιητικό το ρυθμό απορρόφησης του προγράμματος», σημείωσε ότι «για ορισμένα έργα υπάρχουν καθυστερήσεις λόγω των οικονομικών δυσκολιών των τελικών δικαιούχων, της διαδικασίας πρόσκλησης υποβολής προσφορών για τη σύναψη συμβολαίων και των χρονοβόρων διαδικασιών απαλλοτρίωσης ή λόγω διαφόρων αναγκών αδειοδότησης».
Συνεχίζοντας την απάντησή του, ο ευρωπαίος Επίτροπος επεσήμανε ότι «τον Δεκέμβριο του 2012, αναθεωρήθηκαν τα περιφερειακά προγράμματα με σκοπό την ενίσχυση της ανταγωνιστικότητας μέσω στοχοθετημένων ενεργειών για την υποστήριξη των ΜΜΕ». Επιπλέον, πρόσθεσε, «αυτή την εποχή προγραμματίζεται νέα αναθεώρηση», ενώ όπως αναγνώρισε ο ίδιος, «το μετρό της Θεσσαλονίκης είναι ένα από τα σημαντικότερα έργα που καθυστερεί».
