Η ομάδα των Κυκλάδων είχε τιμωρηθεί για τη μη προσέλευσή της στον πέμπτο και τελευταίο αγώνα τη σειράς των περυσινών τελικών, εναντίον του Ηρακλή στη Μίκρα, στις 14 Μαΐου. Η ανακοίνωση της ΕΟΠΕ: «Ο αθλητικός δικαστής επέβαλε στο σωματείο ΑΟ Φοίνικας Σύρου/ΤΑΠ την ποινή αφαίρεσης τριών (3) βαθμών από το πρωτάθλημα της επόμενης αγωνιστικής περιόδου διότι δεν προσήλθε στον τελικό του πρωταθλήματος της Α1 Εθνικής κατηγορίας Ανδρών στις 14/5/12 ΓΣ Ηρακλής–ΑΟ Φοίνικας Σύρου».