Σε δύο φάσεις θα ξεκινήσουν στο Κύπελλο Ελλάδας την περίοδο 2021-22 οι ομάδες της Super League, όπως προβλέπεται στην προκήρυξη της ΕΠΟ για τη φετινή διοργάνωση.
Στην πρώτη φάση θα πάρουν μέρος οι 82 ομάδες της Γ΄ Εθνικής κατηγορίας. Οι τέσσερις πρώτες στην κατάταξη της Super League την αγωνιστική περίοδο 2020-21, δηλαδή οι Ολυμπιακός, ΠΑΟΚ, ΑΕΚ και Άρης θα μπουν από την 6η φάση, ενώ οι υπόλοιπες 10 ομάδες από την 5η φάση.
Ο τελικός θα διεξαχθεί στις 21 Μαΐου, στο ΟΑΚΑ. Ο απινιδωτής είναι υποχρεωτικός σε όλες τις αναμετρήσεις της διοργάνωσης, ενώ πρόστιμο θα επιβάλλεται στους γηπεδούχους σε περίπτωση που δεν είναι διαθέσιμος στο γήπεδο διεξαγωγής της αναμέτρησης.