Την απόκτηση του Γιώργου Καραγκούνη ανακοίνωσε η διοίκηση της Μπενφίκα. Ο έλληνας διεθνής έμεινε ελεύθερος από την Ίντερ και υπέγραψε τριετές συμβόλαιο με τους «Αετούς» όπου θα φοράει τη φανέλα με το Νο 10. Σύμφωνα με ανεπιβεβαίωτες πληροφορίες οι ετήσεις απολαβές του θα ανέρχονται στα 800.000 ευρώ.
«Είμαι έτοιμος να παίξω, εφόσον ο προπονητής μου το θελήσει» τόνισε ο Καραγκούνης στις πρώτες δηλώσεις του μετά την ολοκλήρωση της μεταγραφής του.
Ο 28χρονος διεθνής μεταγράφηκε στους «νερατζούρι» το καλοκαίρι του 2003, ωστόσο δεν κατάφερε να καθιερωθεί στην πρώτη ενδεκάδα της Ίντερ. Πέρυσι αγωνίστηκε σε εννέα παιχνίδια πρωταθλήματος, πέντε κυπέλλου, καθώς και σε τρία (σαν αλλαγή) του Τσάμπιονς Λιγκ.