Δεν προέκυψε ντέρμπι στο Κύπελλο Ελλάδας, καθώς η κλήρωση της προημιτελικής φάσης αλλά και οι διασταυρώσεις στους ημιτελικούς που θα ακολουθήσουν θέλουν αντιμέτωπους Ολυμπιακό και ΠΑΟΚ μόνο στον τελικό, εφόσον βεβαίως οι δύο –θεωρητικά- ισχυρότερες ομάδες, που συνεχίζουν στη διοργάνωση, φτάσουν έως εκεί.
Η κλήρωση των προημιτελικών έφερε τους «ερυθρόλευκους» απέναντι στον ΠΑΣ Γιάννινα και τον «Δικέφαλο» στον Λεβαδειακό, ενώ τα άλλα δύο ζεύγη των προημιτελικών συνθέτουν Πλατανιάς-Αστέρας Τρίπολης και Βέροια-Πανθρακικός.
Οι πρώτοι αγώνες θα διεξαχθούν 27 και 28 Φεβρουαρίου και οι επαναληπτικοί 6, 7, 13 και 14 Μαρτίου. Στους ημιτελικούς θα παίξουν ΠΑΣ Γιάννινα ή Ολυμπιακός- Βέροια ή Πανθρακικός και Πλατανιάς ή Αστέρας Τρίπολης-ΠΑΟΚ ή Λεβαδειακός .
Οι πρώτες συναντήσεις στη φάση των «4» προγραμματίστηκαν για τις 17-18 Απριλίου και οι ρεβάνς στις 27-28 του ίδιου μήνα., ενώ ο τελικός θα διεξαχθεί στις 11 Μαΐου 2013.