Με καταθέσεις συγγενών των θυμάτων του δυστυχήματος με το πρωθυπουργικό Φάλκον στις 14 Σεπτεμβρίου 1999, ξεκίνησε ενώπιον του Γ' τριμελούς Πλημμελειοδικείου η δίκη για την υπόθεση, στην οποία κατηγορούνται δέκα υπάλληλοι της Ολυμπιακής -μεταξύ των οποίων και οι δύο πιλότοι του αεροσκάφους- για τα αδικήματα της ανθρωποκτονίας από αμέλεια και σωματικών βλαβών από αμέλεια.
Το δικαστήριο απέρριψε αίτημα αναβολής που υπέβαλαν συνήγοροι υπεράσπισης, καθώς και η Ολυμπιακή Αεροπορία, που παρεμβαίνει υπέρ των κατηγορουμένων.
Το αίτημα είχε ως αντικείμενο τη διερεύνηση από ανεξάρτητη αρχή, όπως ορίζεται σε Κοινοτική Οδηγία, των αιτιών του δυστυχήματος.
Επιπλέον, όπως ανέφεραν οι συνήγοροι, διαπιστώθηκε ότι η κατασκευάστρια εταιρεία του αυτόματου πιλότου είχε δώσει αριθμό ταυτότητας στο σύστημα ίδιο με αυτόν άλλου αεροσκάφους τύπου Φάλκον, που εμφάνισε το ίδιο ακριβώς πρόβλημα σε πτήση του στην Αμερική, λίγο καιρό μετά. Για το λόγο αυτό η Ολυμπιακή υπέβαλε πριν λίγες μέρες μήνυση κατά της κατασκευάστριας εταιρείας Ντασό για διατάραξη ασφάλειας πτήσης.
