Αντιπαράθεση για την απορρόφηση των κοινοτικών κονδυλίων σημειώθηκε ανάμεσα στην κυβέρνηση και τη Νέα Δημοκρατία.
Ο ευρωβουλευτής της ΝΔ Κ. Χατζηδάκης σε συνέντευξη Τύπου κατήγγειλε ότι οι Ελληνες αγρότες, έχασαν το χρονικό διάστημα 1994-1999, πάνω από 166 δισ. δρχ. Επρεπε, είπε ο κ. Χατζηδάκης, να πάρουμε 166 δισ. δρχ. για γεωργοπεριβαλλοντικές δράσεις και πήραμε μόνο οκτώ δισ. δραχμές.
Σε απάντηση από το υπουργείο Γεωργίας ανακοινώθηκε ότι ο κ. Χατζηδάκης χρησιμοποιεί κατά το δοκούν απαντήσεις της Επιτροπής, ακολουθώντας την εύκολη οδό των υπερβολών, προκειμένου να εντυπωσιάσει.
Την περίοδο, συνεχίζει η ανακοίνωση 1994-1999, το ποσό της ενίσχυσης που εγκρίθηκε για αγροπεριβαλλοντικά προγράμματα έφτασε τα 25 δισ. δρχ. και από αυτά απορροφήθηκαν 11 δισ. δραχμές.