Μουσείο παραμένει η Αγία Σοφία αφότου το Συνταγματικό Δικαστήριο της Τουρκίας απέρριψε το αίτημα της Ένωσης Μόνιμων Βακουφίων Ιστορικών Μνημείων και Περιβάλλοντος για τη μετατροπή της σε τζαμί.

Η Ένωση είχε κάνει την πρώτη προσφυγή το 2004, ώστε να ανοίξει για μουσουλμανική προσευχή η Αγία Σοφία. Το 2005 υπεβλήθη νέα προς το Συμβούλιο της Επικρατείας, η οποία απορρίφθηκε.

Η Ένωση επανήλθε το 2015, προσφεύγοντας στο Συνταγματικό Δικαστήριο υποστηρίζοντας πως η άρνηση στο αίτημα να επιτραπεί η προσευχή στην Αγία Σοφία παραβιάζει τη θρησκευτική ελευθερία.