«Στην κοινή συνείδηση του μέσου ΄Ελληνος έχει δημιουργηθεί ατυχώς η πεπλανημένη εντύπωση ότι η κάθαρση δεν έχει προχωρήσει σε βάθος. Η εντύπωση αυτή μας αδικεί κατάφωρα, επειδή η Διαρκής Ιερά Σύνοδος έχει επιληφθεί καθ' όλο τούτο το διάστημα με ιδιαίτερη προσοχή και αποτελεσματικότητα του θέματος της αυτοκαθάρσεως και συνεχίζει», τόνισε ο Αρχιεπίσκοπος Χριστόδουλος κατά την έκτακτη συνεδρίαση της Ιεραρχίας για την πλήρωση της μητρόπολης Θεσσαλιώτιδος http://www.naftemporiki.gr/news/static/05/06/27/1065098.htm .
Ο κ. Χριστόδουλος προέβλεψε αναζωπύρωση της κρίσης, με αφορμή την προώθηση των ιδεών για το διαχωρισμό Εκκλησίας-Κράτους, ωστόσο απέρριψε την πρόταση του μητροπολίτη Ναυπάκτου για συγκρότηση επιτροπής μελέτης του θέματος.