Η Ευρωπαϊκή Επιτροπή αποφάσισε να προσφύγει στο Δικαστήριο της ΕΕ κατά της Ελλάδας λόγω πλημμελούς εφαρμογής τριών αποφάσεων του ΔΕΚ που καταδίκαζαν την Ελλάδα όσον αφορά την επιστροφή αχρεωστήτως καταβληθέντων φόρων, περιλαμβανομένου του ΦΠΑ.
Η Ευρωπαϊκή Επιτροπή αποφάσισε να προσφύγει στο Δικαστήριο της ΕΕ κατά της Ελλάδας λόγω πλημμελούς εφαρμογής τριών αποφάσεων του ΔΕΚ που καταδίκαζαν την Ελλάδα όσον αφορά την επιστροφή αχρεωστήτως καταβληθέντων φόρων, περιλαμβανομένου του ΦΠΑ.
Σύμφωνα με το δίκαιο της ΕΕ οι φορολογούμενοι δικαιούνται επιστροφής των παρακρατηθέντων από τα κράτη μέλη φόρων κατά παράβαση του δικαίου της ΕΕ. Η Ελλάδα δεν επιτρέπει αυτήν την επιστροφή φόρων.
Στις περιπτώσεις που διαπιστώνεται ότι κράτος μέλος έχει επιβάλει φόρο κατά παράβαση του δικαίου της ΕΕ, τα φυσικά πρόσωπα έχουν το δικαίωμα να επιδιώξουν και να επιτύχουν την επιστροφή του αχρεωστήτως, σύμφωνα με την ενωσιακή νομοθεσία, καταβληθέντος φόρου.
Σε τρεις περιπτώσεις η Ελλάδα καταδικάστηκε από το ΔΕΚ λόγω κακής εφαρμογής της οδηγίας για τον ΦΠΑ, κατά τρόπο που θα έπρεπε να είχε προσδώσει στους υπόχρεους φόρου το δικαίωμα επιστροφής του αχρεωστήτως καταβληθέντος ΦΠΑ ή το δικαίωμα φορολογικής έκπτωσης.
Στην πράξη η Ελλάδα απέκλεισε τη δυνατότητα τέτοιων επιστροφών ή εκπτώσεων φόρου.
Η Επιτροπή απηύθυνε αιτιολογημένη γνώμη στην Ελλάδα, αντίστοιχα, τον Φεβρουάριο του 2008 και τον Οκτώβριο του 2009. Όμως, καθώς η Ελλάδα δεν έλαβε τα προσήκοντα μέτρα, η Επιτροπή αποφάσισε πλέον να φέρει τις υποθέσεις ενώπιον του Δικαστηρίου.