Την ακτοπλοϊκή σύνδεση των Κυθήρων με τον Πειραιά, κατά το χρονικό διάστημα από 10-07-06 έως 31-10-06, με δεύτερο επιδοτούμενο δρομολόγιο κάθε Δευτέρα, με το Ε/Γ- Ο/Γ «ΜΥΡΤΙΔΙΩΤΙΣΣΑ», πέραν του ήδη υπάρχοντος επιδοτούμενου δρομολογίου της Παρασκευής, ανακοίνωσε το ΥΕΝ.
Επίσης, στην ίδια Απόφαση προβλέπεται η υποχρέωση της πλοιοκτήτριας εταιρείας για τη δωρεάν μετακίνηση των μονίμων κατοίκων των Κυθήρων- Αντικυθήρων από και προς το Γύθειο στο δρομολόγιο «Γύθειο - Κύθηρα- Αντικύθηρα - Κίσσαμος».
Εξάλλου, με άλλη απόφαση του υπουργού Εμπορικής Ναυτιλίας, για το χρονικό διάστημα από 10-07-2006 έως 10-09-2006, το Ε/Γ-Ο/Γ «ΕΞΠΡΕΣ ΣΑΝΤΟΡΙΝΗ» θα προσεγγίζει την νήσο Ανάφη στο δρομολόγιο της Δευτέρας, «Πειραιάς- Πάρος - Νάξος - Ίος - Θήρα - Ανάφη», με μισθούμενο τμήμα το «Θήρα - Ανάφη».
Η Ανάφη συνδέεται με τον Πειραιά και με άλλα δύο επιδοτούμενα δρομολόγια την εβδομάδα, με Ε/Γ - Ο/Γ πλοίο της κοινοπραξίας «G.A. FERRIES».